Στην αίθουσα 2 δίνεται έμφαση στο ρόλο του υγρού στοιχείου για τη Σάμη και ιδιαίτερα για τη ρωμαϊκή πόλη, όπου εντοπίζονται σημαντικές εγκαταστάσεις που σχετίζονται με τη χρήση του νερού, όπως μία κρήνη και λουτρικά συγκροτήματα, τα κατάλοιπα των οποίων καταλαμβάνουν ένα μεγάλο τμήμα της Σάμης.
Για το λόγο αυτό δημιουργήθηκε αναπαραγωγή τμήματος υπόκαυστου χώρου σε συνδυασμό με αναπαράσταση διαδικασίας λουτρού. Μάλιστα, το εποπτικό υλικό δίνει την ευκαιρία στον επισκέπτη να ενημερωθεί για τα λουτρά τόσο της Σάμης, όσο και του Φισκάρδου.
Παράλληλα, η σημασία της θάλασσας για τους κατοίκους της Σάμης και της πόλης Πανόρμου γίνεται αντιληπτή στην ενότητα «Θαλάσσιες μεταφορές – Ενάλιες ανασκαφές».