Στην αίθουσα 1 της Αρχαιολογικής Συλλογής Σάμης φιλοξενούνται ευρήματα από τη Σάμη που αποδεικνύουν την αδιάκοπη ανθρώπινη δράση στην ευρύτερη περιοχή της από την εποχή του Χαλκού και παράλληλα, δίνονται πληροφορίες για την εξέλιξη της πόλης στο χρόνο.
Εκτίθενται δείγματα της επιγραφικής και της γλυπτικής.
Επίσης, περιλαμβάνονται αντικείμενα που σχετίζονται με τα οικιστικά κατάλοιπα και ενημερώνεται ο επισκέπτης για τρόπους δόμησης, που ακολουθούνταν τόσο στη Σάμη, όσο και την πόλη Πάνορμο.
